Gracias Jantoni, por la recomendación.
Me pongo manos a la obra. Ya he hecho algunas pruebas y estos son los resultados en cuanto a velocidad:
Raspberry Pi2 con sistema de archivos en pendrive:
pi@raspi2 ~ $ dd if=/dev/zero of=/tmp/out bs=1M count=300
300+0 registros leídos
300+0 registros escritos
314572800 bytes (315 MB) copiados, 25,8521 s, 12,2 MB/s
Raspberry Pi2 con sistema de archivos en tarjeta SD clase 10:
pi@raspberrypi ~ $ dd if=/dev/zero of=/tmp/out bs=1M count=300
300+0 registros leídos
300+0 registros escritos
314572800 bytes (315 MB) copiados, 19,5235 s, 16,1 MB/s
Gana en velocidad la tarjeta SD, pero si es más fiable el Pendrive...
Saludos.