Si tuvieses acceso al registro de accesos al ftp de tu hosting, sería más o menos fácil ver qué es lo que ocurre. En mi caso, no es raro que se pierda algún envío, y casi siempre me coincide con algún error en los envíos desde el PC hacia el FTP.
Pero bueno, sin ver el registro, es como tocar de oído, podemos hacer conjeturas, pero poco más.