La estación es nueva. Está bien. No necesitas tocar ningún tornillo, ni recalibrar nada.
La diferencia entre pluviómetros va a ser algo frecuente, entre otras cosas dependerá del tipo de precipitación, del viento, etc.
Aún estando juntos y siendo idénticos, dos pluviómetros no darán siempre la misma precipitación; en ocasiones habrá diferencias. Es normal.
Por otra parte, si te atienes a una sola vez en que ha llovido, me temo que no podrás sacar ninguna conclusión válida sobre las diferentes mediciones obtenidas. Se trata de observar durante un tiempo largo, para establecer diferencias, o márgenes de error. Si llegara el caso, sería después de ese largo tiempo cuando habría que tocar tornillos.
En resumen: déjalo estar, no te preocupes mucho, sigue observando.
A medio plazo, cuando solicites auditoría y obtengas la homologación con pluviómetro manual, prevalecerán los resultados obtenidos por el CoCoRash.