En su dia tuve que hacer lo mismo pero con una emisora de radio que la tenian que controlar dos programas a la vez. El supuesto es el mismo, un dispositivo que genera un puerto serie y dos softwares que tiran del mismo. Yo lo solucioné via software, un programa que te genera puertos virtuales sobre el REAL, con lo que a cada programa le dabas el puerto virtual y la informacion en ambos era la del puerto real. No recuerdo el nombre del programa, lo que recuerdo seguro es que era de pago, pero vamos, seguro que lo encentras gratis tambien.
Un saludo y luego te investigo un poco mas el tema, que seguro que tengo algo guardado.