Si, creo que es perfectamente posible.
El asunto es que, al diferenciar dos fuentes de datos, deben crearse 2 tablas en la misma base de datos.
Estación_a: meteotemplatea >> tabla "alldata"
Estación_b: meteotemplateb >> tabla "alldatab"
Luego te lo explico con mas detalle
Para empezar, puedes empezar a instalar la primera estación en un directorio llamado, por ejemplo, "meteotemplatea"
Así veras como se instala la plantilla desde el principio. Luego, mas tarde, instalas la segunda estación/plantilla.