Los loops son cadenas de datos de los sensores que envía la consola al programa que los solicita cada 2-3 segundos aproximadamente. En ellos están la temperatura actual, humedad, racha de viento etc etc.
De lo que se ve en el foro de weewx ese comportamiento que se te está dando es por que no le llegan los 99 datos del loop, o lo que es lo mismo, que tiene problema de comunicación la Raspi con la consola.
Has conectado la Davis con el USB de la Davis o le has puesto un alargador USB ?