Puede que tengas algún archivo *.wlk corrompido.
Yo probaría: parar Weatherlink y dejar la consola sin suministro eléctrico (eso es, sacando también las pilas). Ponerla otra vez en marcha y ajustar correctamente el reloj (que probablemente no marque bien los minutos)
Luego:
Hacer copia de seguridad todos los archivos *.wlk
Borrar uno a uno los archivos *.wlk de uno en uno, empezando por el último, y arrancando luego el Weatherlink, intentando descargar los datos del datalogger.
Si con el último no funciona, hacerlo con el anterior, y así sucesivamente.
Es posible que el único que esté mal sea el del mes de abril. Si al borrar este funciona, en principio reponiendo todos los *.wlk desde las copias, excepto el de abril, posiblemente se puedan recuperar muchos datos.