Hay dos causas, que se pueden sobreponer.
1a en meteoclimatic, por su estructura, los datos no aparecen inmediatamente. Es posible pues que en un momento dado haya alguna discrepacia hasta que se actualicen.
2a tanto atmos.cat como meteoclimatic utilizan el horario UTC, es decir que, a efectos prácticos, la hora de reseteo de las variables sucede, en horario de verano, a las dos de la madrugada. Con ello puede que la lluvia caída se contabilice en días distintos según los horarios de cada sistema, es por ello que lo que muestra atmos.cat y meteoclimatic.net difieran de lo que se ve en la consola. No se trata de ningún error, sinó simplemente de dos sistemas distintos.
El porqué está explicado por diversos sitios de modo bastante exhaustivo en este foro, y es necesario por los errores de programación que muchas de estas estaciones llevan de fábrica, que de este modo quedan subsanados.