Gracias Jantoni,
He estado probando tanto con el wput como "manualmente" (con el comando ftp), y la verdad es que no hay manera... digamos que 1 de cada 2 veces se queda pillado con cada archivo.
Además, en el caso "manual" parece como si sólo me dejara mandar (y no siempre) un único archivo por sesión. Cuando voy a mandar el segundo, el 99% de las veces se queda bloqueado: tengo que desconectarme y volver a conectarme cada vez que quiero mandar un archivo... y aún así como digo, muchas veces ni haciendo eso funciona.
Esto lo he probado con dos servidores distintos (climaynievepirineos.com y eu5.org) y pasa lo mismo en ambos
Por ahora, lo voy a tener que posponer hasta el fin de semana que viene. Seguramente tendré que hacer una instalación limpia y pasar los skins y la base de datos.
Mi conclusión es que el FTP de la Raspberry (no del Weewx, sino en general) ha dejado de funcionar bien, así que a ver si haciendo esto se soluciona...
Un saludo y gracias por todo