Veamos.
Cuando conectas Weewx por primera vez al datalogger, lo primero que hace es leer todos los datos que hay almacenados en la memoria.
Por ese motivo, tienes datos antiguos en Weewx. Son los datos almacenados en la memoria del datalogger.
No me has respondido a la pregunta de si has usado la antigua base de datos de Wview en Weewx. Si la respuesta es afirmativa, Weewx va a recorrer todos los datos de la base de datos, por lo que puede tardar un poco, mucho o muchísimo, todo ello en función de la cantidad de datos almacenada.
Tampoco has respondido a la pregunta de que sistema de instalación has seguido.
Si has usado los oficiales, entonces el log es una guarrada, porque se mezcla con el log del sistema.
Si has utilizado el script "meteowee" que te instala Weewx con los ojos cerrados, entonces el log es utilizable, ya que está aislado en /var/log/weewx.log
En función del sistema te podremos orientar con el log.
Pero necesitamos pistas.